Browsing by Author Ariyaratne, P.N.

Showing results 1 to 9 of 9
Issue DateTitleAuthor(s)
Apr-2012A common BIM deletion polymorphism mediates intrinsic resistance and inferior responses to tyrosine kinase inhibitors in cancerNg, K.P.; Hillmer, A.M.; Chuah, C.T.H.; Juan, W.C.; Ko, T.K. ; Teo, A.S.M.; Ariyaratne, P.N.; Takahashi, N.; Sawada, K.; Fei, Y.; Soh, S.; Lee, W.H.; Huang, J.W.J.; Allen Jr., J.C.; Woo, X.Y.; Nagarajan, N.; Kumar, V.; Thalamuthu, A.; Poh, W.T.; Ang, A.L.; Mya, H.T.; How, G.F.; Yang, L.Y.; Koh, L.P.; Chowbay, B.; Chang, C.-T.; Nadarajan, V.S.; Chng, W.J.; Than, H.; Lim, L.C.; Goh, Y.T.; Zhang, S.; Poh, D.; Tan, P. ; Seet, J.-E.; Ang, M.-K.; Chau, N.-M.; Ng, Q.-S.; Tan, D.S.W.; Soda, M.; Isobe, K.; Nöthen, M.M.; Wong, T.Y. ; Shahab, A.; Ruan, X.; Cacheux-Rataboul, V.; Sung, W.-K.; Tan, E.H.; Yatabe, Y.; Mano, H.; Soo, R.A. ; Chin, T.M. ; Lim, W.-T.; Ruan, Y. ; Ong, S.T.
2009An oestrogen-receptor-α-bound human chromatin interactomeFullwood, M.J.; Liu, M.H.; Pan, Y.F.; Liu, J.; Xu, H.; Mohamed, Y.B.; Orlov, Y.L.; Velkov, S.; Ho, A.; Mei, P.H.; Chew, E.G.Y.; Huang, P.Y.H.; Han, Y.; Ooi, H.S.; Ariyaratne, P.N.; Vega, V.B.; Luo, Y.; Tan, P.Y.; Choy, P.Y.; Wansa, K.D.S.A.; Zhao, B.; Lim, K.S.; Leow, S.C.; Yow, J.S.; Joseph, R.; Li, H.; Desai, K.V.; Thomsen, J.S.; Lee, Y.K.; Karuturi, R.K.M.; Herve, T.; Bourque, G.; Ruan, X.; Cacheux-Rataboul, V.; Sung, W.-K. ; Liu, E.T.; Wei, C.-L.; Cheung, E.; Ruan, Y. ; Welboren, W.-J.; Stunnenberg, H.G.
5-Nov-2009An oestrogen-receptor-α-bound human chromatin interactomeFullwood, M.J.; Liu, M.H.; Pan, Y.F.; Liu, J.; Xu, H.; Mohamed, Y.B.; Orlov, Y.L.; Velkov, S.; Ho, A.; Mei, P.H.; Chew, E.G.Y.; Huang, P.Y.H.; Welboren, W.-J.; Han, Y.; Ooi, H.S.; Ariyaratne, P.N.; Vega, V.B.; Luo, Y.; Tan, P.Y.; Choy, P.Y.; Wansa, K.D.S.A.; Zhao, B.; Lim, K.S.; Leow, S.C.; Yow, J.S.; Joseph, R.; Li, H.; Desai, K.V.; Thomsen, J.S.; Lee, Y.K.; Karuturi, R.K.M.; Herve, T.; Bourque, G.; Stunnenberg, H.G.; Ruan, X.; Cacheux-Rataboul, V.; Sung, W.-K. ; Liu, E.T.; Wei, C.-L.; Cheung, E.; Ruan, Y. 
2011Assemblathon 1: A competitive assessment of de novo short read assembly methodsEarl, D.; Bradnam, K.; St. John, J.; Darling, A.; Lin, D.; Fass, J.; Yu, H.O.K.; Buffalo, V.; Zerbino, D.R.; Diekhans, M.; Nguyen, N.; Ariyaratne, P.N.; Sung, W.-K. ; Ning, Z.; Haimel, M.; Simpson, J.T.; Fonseca, N.A.; Birol, I.; Docking, T.R.; Ho, I.Y.; Rokhsar, D.S.; Chikhi, R.; Lavenier, D.; Chapuis, G.; Naquin, D.; Maillet, N.; Schatz, M.C.; Kelley, D.R.; Phillippy, A.M.; Koren, S.; Yang, S.-P.; Wu, W.; Chou, W.-C.; Srivastava, A.; Shaw, T.I.; Ruby, J.G.; Skewes-Cox, P.; Betegon, M.; Dimon, M.T.; Solovyev, V.; Seledtsov, I.; Kosarev, P.; Vorobyev, D.; Ramirez-Gonzalez, R.; Leggett, R.; MacLean, D.; Xia, F.; Luo, R.; Li, Z.; Xie, Y.; Liu, B.; Gnerre, S.; MacCallum, I.; Przybylski, D.; Ribeiro, F.J.; Sharpe, T.; Hall, G.; Kersey, P.J.; Durbin, R.; Jackman, S.D.; Chapman, J.A.; Huang, X.; DeRisi, J.L.; Caccamo, M.; Li, Y.; Jaffe, D.B.; Green, R.E.; Haussler, D.; Korf, I.; Paten, B.
2010ChIA-PET tool for comprehensive chromatin interaction analysis with paired-end tag sequencingLi, G. ; Xu, H.; Mulawadi, F.H.; Velkov, S.; Vega, V.; Ariyaratne, P.N.; Mohamed, Y.B.; Ooi, H.-S.; Sung, W.-K. ; Fullwood, M.J. ; Wei, C.-L. ; Ruan, Y. ; Tennakoon, C.
May-2011Comprehensive long-span paired-end-tag mapping reveals characteristic patterns of structural variations in epithelial cancer genomesHillmer, A.M.; Yao, F.; Inaki, K.; Lee, W.H.; Ariyaratne, P.N.; Teo, A.S.M.; Woo, X.Y.; Zhang, Z.; Zhao, H.; Ukil, L.; Chen, J.P.; Zhu, F.; So, J.B.Y.; Salto-Tellez, M. ; Poh, W.T.; Zawack, K.F.B.; Nagarajan, N.; Gao, S.; Li, G.; Kumar, V.; Lim, H.P.J.; Sia, Y.Y.; Chan, C.S.; Leong, S.T.; Neo, S.C.; Choi, P.S.D.; Thoreau, H.; Tan, P.B.O. ; Shahab, A.; Ruan, X.; Bergh, J.; Hall, P.; Cacheux-Rataboul, V.; Wei, C.-L.; Yeoh, K.G.; Sung, W.-K.; Bourque, G.; Liu, E.T.; Ruan, Y. 
2012Genome-wide survey of recurrent HBV integration in hepatocellular carcinomaSung, W.-K. ; Zheng, H.; Li, S.; Chen, R.; Liu, X.; Li, Y.; Lee, N.P.; Lee, W.H.; Ariyaratne, P.N.; Tennakoon, C.; Mulawadi, F.H.; Wong, K.F. ; Liu, A.M. ; Poon, R.T.; Fan, S.T.; Chan, K.L.; Gong, Z.; Hu, Y.; Lin, Z.; Wang, G.; Zhang, Q.; Barber, T.D.; Chou, W.-C.; Aggarwal, A.; Hao, K.; Zhou, W.; Zhang, C.; Hardwick, J.; Buser, C.; Xu, J.; Kan, Z.; Dai, H.; Mao, M.; Reinhard, C.; Wang, J.; Luk, J.M.
28-Sep-2012Long Span DNA Paired-End-Tag (DNA-PET) Sequencing Strategy for the Interrogation of Genomic Structural Mutations and Fusion-Point-Guided Reconstruction of AmpliconsYao, F.; Ariyaratne, P.N.; Hillmer, A.M.; Lee, W.H.; Li, G.; Teo, A.S.M.; Woo, X.Y.; Zhang, Z.; Chen, J.P.; Poh, W.T.; Zawack, K.F.B.; Chan, C.S.; Leong, S.T.; Neo, S.C.; Choi, P.S.D.; Gao, S.; Nagarajan, N.; Thoreau, H.; Shahab, A.; Ruan, X.; Cacheux-Rataboul, V.; Wei, C.-L.; Bourque, G.; Sung, W.-K.; Liu, E.T.; Ruan, Y. 
2011PE-Assembler: De novo assembler using short paired-end readsAriyaratne, P.N.; Sung, W.-K.